Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP3Q9Y446 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms