Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms