Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms