Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms