Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms