Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms