Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 AC007919.2-201ENST00000444110 511 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms