Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMC4Q9NTJ3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMC4Q9NTJ3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms