Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms