Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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