Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms