Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms