Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms