Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms