Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SUSD3Q96L08 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SUSD3Q96L08 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD3Q96L08 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms