Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
BORCS6Q96GS4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BORCS6Q96GS4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms