Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX29Q8TEQ0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms