Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms