Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms