Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms