Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms