Protein–RNA interactions for Protein: Q495Y8

SPDYE2, Speedy protein E2, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE2Q495Y8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPDYE2Q495Y8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPDYE2Q495Y8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE2Q495Y8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms