Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F4Q16254 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F4Q16254 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F4Q16254 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F4Q16254 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F4Q16254 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F4Q16254 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F4Q16254 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.3■■□□□ 1
E2F4Q16254 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F4Q16254 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F4Q16254 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F4Q16254 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F4Q16254 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F4Q16254 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F4Q16254 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F4Q16254 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F4Q16254 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F4Q16254 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F4Q16254 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F4Q16254 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F4Q16254 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F4Q16254 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F4Q16254 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F4Q16254 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F4Q16254 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F4Q16254 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F4Q16254 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F4Q16254 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F4Q16254 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F4Q16254 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F4Q16254 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F4Q16254 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F4Q16254 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F4Q16254 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F4Q16254 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F4Q16254 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F4Q16254 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F4Q16254 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
E2F4Q16254 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F4Q16254 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F4Q16254 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F4Q16254 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.29■■□□□ 1
E2F4Q16254 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F4Q16254 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F4Q16254 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F4Q16254 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F4Q16254 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F4Q16254 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F4Q16254 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F4Q16254 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F4Q16254 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F4Q16254 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F4Q16254 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F4Q16254 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F4Q16254 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F4Q16254 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F4Q16254 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F4Q16254 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F4Q16254 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F4Q16254 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F4Q16254 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F4Q16254 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.28■■□□□ 1
E2F4Q16254 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.28■■□□□ 1
E2F4Q16254 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F4Q16254 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F4Q16254 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F4Q16254 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F4Q16254 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F4Q16254 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F4Q16254 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F4Q16254 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F4Q16254 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F4Q16254 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F4Q16254 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F4Q16254 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F4Q16254 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F4Q16254 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F4Q16254 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F4Q16254 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F4Q16254 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F4Q16254 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F4Q16254 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F4Q16254 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F4Q16254 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F4Q16254 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.27■■□□□ 1
E2F4Q16254 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F4Q16254 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.27■■□□□ 1
E2F4Q16254 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F4Q16254 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F4Q16254 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F4Q16254 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F4Q16254 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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