Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLAMF1Q13291 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms