Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms