Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
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