Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms