Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms