Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRG1Q02297 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRG1Q02297 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRG1Q02297 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NRG1Q02297 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRG1Q02297 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRG1Q02297 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRG1Q02297 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRG1Q02297 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRG1Q02297 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRG1Q02297 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRG1Q02297 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRG1Q02297 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRG1Q02297 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRG1Q02297 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRG1Q02297 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NRG1Q02297 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRG1Q02297 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms