Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms