Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPM4P67936 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPM4P67936 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TPM4P67936 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TPM4P67936 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPM4P67936 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPM4P67936 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPM4P67936 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPM4P67936 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPM4P67936 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPM4P67936 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPM4P67936 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPM4P67936 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPM4P67936 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPM4P67936 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TPM4P67936 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPM4P67936 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPM4P67936 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPM4P67936 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPM4P67936 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPM4P67936 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPM4P67936 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPM4P67936 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPM4P67936 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TPM4P67936 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPM4P67936 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPM4P67936 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPM4P67936 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPM4P67936 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPM4P67936 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPM4P67936 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TPM4P67936 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPM4P67936 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPM4P67936 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPM4P67936 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPM4P67936 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPM4P67936 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPM4P67936 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPM4P67936 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPM4P67936 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPM4P67936 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TPM4P67936 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPM4P67936 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPM4P67936 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPM4P67936 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPM4P67936 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPM4P67936 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPM4P67936 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPM4P67936 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPM4P67936 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPM4P67936 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TPM4P67936 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPM4P67936 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPM4P67936 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPM4P67936 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPM4P67936 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPM4P67936 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TPM4P67936 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TPM4P67936 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TPM4P67936 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TPM4P67936 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TPM4P67936 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPM4P67936 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPM4P67936 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPM4P67936 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPM4P67936 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPM4P67936 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPM4P67936 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPM4P67936 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPM4P67936 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPM4P67936 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPM4P67936 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms