Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRCA2P51587 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BRCA2P51587 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRCA2P51587 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRCA2P51587 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms