Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VEGFBP49765 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms