Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRATP43155 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CRATP43155 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRATP43155 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRATP43155 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRATP43155 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRATP43155 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRATP43155 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRATP43155 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRATP43155 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRATP43155 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CRATP43155 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRATP43155 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRATP43155 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CRATP43155 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRATP43155 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRATP43155 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRATP43155 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRATP43155 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRATP43155 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRATP43155 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRATP43155 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CRATP43155 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRATP43155 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRATP43155 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRATP43155 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRATP43155 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRATP43155 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRATP43155 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms