Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
NCAPD3P42695 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NCAPD3P42695 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NCAPD3P42695 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NCAPD3P42695 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NCAPD3P42695 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NCAPD3P42695 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NCAPD3P42695 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NCAPD3P42695 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
NCAPD3P42695 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
NCAPD3P42695 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NCAPD3P42695 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NCAPD3P42695 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NCAPD3P42695 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NCAPD3P42695 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NCAPD3P42695 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NCAPD3P42695 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NCAPD3P42695 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NCAPD3P42695 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
NCAPD3P42695 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NCAPD3P42695 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms