Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ETFBP38117 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ETFBP38117 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ETFBP38117 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETFBP38117 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ETFBP38117 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETFBP38117 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETFBP38117 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETFBP38117 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETFBP38117 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETFBP38117 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETFBP38117 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETFBP38117 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETFBP38117 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETFBP38117 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETFBP38117 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETFBP38117 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ETFBP38117 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETFBP38117 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETFBP38117 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETFBP38117 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETFBP38117 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETFBP38117 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETFBP38117 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETFBP38117 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETFBP38117 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETFBP38117 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETFBP38117 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETFBP38117 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ETFBP38117 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETFBP38117 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETFBP38117 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETFBP38117 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETFBP38117 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETFBP38117 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETFBP38117 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETFBP38117 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETFBP38117 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETFBP38117 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETFBP38117 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETFBP38117 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETFBP38117 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETFBP38117 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETFBP38117 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETFBP38117 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETFBP38117 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETFBP38117 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETFBP38117 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETFBP38117 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETFBP38117 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETFBP38117 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETFBP38117 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETFBP38117 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ETFBP38117 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETFBP38117 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETFBP38117 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETFBP38117 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETFBP38117 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETFBP38117 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETFBP38117 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETFBP38117 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETFBP38117 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETFBP38117 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ETFBP38117 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFBP38117 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFBP38117 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFBP38117 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFBP38117 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFBP38117 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFBP38117 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFBP38117 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFBP38117 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFBP38117 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFBP38117 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFBP38117 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFBP38117 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFBP38117 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFBP38117 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFBP38117 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFBP38117 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFBP38117 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFBP38117 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFBP38117 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFBP38117 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFBP38117 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFBP38117 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFBP38117 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFBP38117 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFBP38117 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFBP38117 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFBP38117 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFBP38117 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFBP38117 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFBP38117 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFBP38117 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFBP38117 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFBP38117 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFBP38117 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFBP38117 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFBP38117 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms