Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC132192.1-201ENST00000531111 597 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 RPL23AP49-202ENST00000638439 1138 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 GPR15-201ENST00000284311 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 HYI-AS1-201ENST00000444386 545 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 LINC01697-206ENST00000616647 544 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 MGST3-214ENST00000627653 1130 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 APOBEC3H-204ENST00000442487 988 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC006333.1-204ENST00000429396 648 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC073911.2-201ENST00000624989 468 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms