Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms