Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms