Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NF1P21359 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NF1P21359 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NF1P21359 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NF1P21359 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NF1P21359 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NF1P21359 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NF1P21359 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NF1P21359 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NF1P21359 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms