Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms