Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRF1P14222 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRF1P14222 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PRF1P14222 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRF1P14222 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRF1P14222 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRF1P14222 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRF1P14222 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRF1P14222 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRF1P14222 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PRF1P14222 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRF1P14222 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRF1P14222 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PRF1P14222 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRF1P14222 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRF1P14222 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRF1P14222 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRF1P14222 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PRF1P14222 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PRF1P14222 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRF1P14222 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRF1P14222 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PRF1P14222 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRF1P14222 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRF1P14222 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRF1P14222 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRF1P14222 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRF1P14222 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRF1P14222 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRF1P14222 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRF1P14222 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRF1P14222 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRF1P14222 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRF1P14222 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRF1P14222 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRF1P14222 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRF1P14222 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PRF1P14222 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRF1P14222 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRF1P14222 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRF1P14222 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRF1P14222 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRF1P14222 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PRF1P14222 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRF1P14222 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRF1P14222 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRF1P14222 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRF1P14222 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRF1P14222 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRF1P14222 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRF1P14222 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRF1P14222 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRF1P14222 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PRF1P14222 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRF1P14222 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRF1P14222 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRF1P14222 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRF1P14222 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRF1P14222 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRF1P14222 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRF1P14222 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRF1P14222 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRF1P14222 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRF1P14222 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRF1P14222 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRF1P14222 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRF1P14222 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms