Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3P10147 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3P10147 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3P10147 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3P10147 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3P10147 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3P10147 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3P10147 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3P10147 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3P10147 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3P10147 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3P10147 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3P10147 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3P10147 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3P10147 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3P10147 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3P10147 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3P10147 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3P10147 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3P10147 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3P10147 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3P10147 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3P10147 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3P10147 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3P10147 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3P10147 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3P10147 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms