Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GLI2P10070 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GLI2P10070 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GLI2P10070 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLI2P10070 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLI2P10070 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLI2P10070 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLI2P10070 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLI2P10070 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLI2P10070 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLI2P10070 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GLI2P10070 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLI2P10070 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLI2P10070 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLI2P10070 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLI2P10070 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLI2P10070 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLI2P10070 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLI2P10070 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLI2P10070 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLI2P10070 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI2P10070 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI2P10070 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI2P10070 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI2P10070 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI2P10070 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI2P10070 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI2P10070 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI2P10070 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI2P10070 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI2P10070 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI2P10070 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI2P10070 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI2P10070 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI2P10070 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI2P10070 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI2P10070 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI2P10070 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI2P10070 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI2P10070 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI2P10070 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
GLI2P10070 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
GLI2P10070 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
GLI2P10070 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.24
GLI2P10070 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GLI2P10070 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GLI2P10070 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
GLI2P10070 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
GLI2P10070 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GLI2P10070 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GLI2P10070 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GLI2P10070 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GLI2P10070 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GLI2P10070 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GLI2P10070 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GLI2P10070 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GLI2P10070 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
GLI2P10070 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GLI2P10070 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GLI2P10070 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GLI2P10070 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GLI2P10070 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GLI2P10070 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GLI2P10070 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GLI2P10070 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GLI2P10070 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GLI2P10070 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GLI2P10070 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GLI2P10070 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GLI2P10070 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
GLI2P10070 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GLI2P10070 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
GLI2P10070 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GLI2P10070 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GLI2P10070 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GLI2P10070 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GLI2P10070 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GLI2P10070 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GLI2P10070 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GLI2P10070 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GLI2P10070 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GLI2P10070 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GLI2P10070 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GLI2P10070 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GLI2P10070 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GLI2P10070 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GLI2P10070 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GLI2P10070 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GLI2P10070 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GLI2P10070 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GLI2P10070 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GLI2P10070 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GLI2P10070 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GLI2P10070 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GLI2P10070 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GLI2P10070 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GLI2P10070 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GLI2P10070 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GLI2P10070 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GLI2P10070 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms