Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPLO60437 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPLO60437 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPLO60437 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPLO60437 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPLO60437 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPLO60437 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPLO60437 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPLO60437 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PPLO60437 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPLO60437 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPLO60437 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPLO60437 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPLO60437 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPLO60437 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPLO60437 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPLO60437 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPLO60437 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPLO60437 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPLO60437 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPLO60437 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPLO60437 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPLO60437 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PPLO60437 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPLO60437 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPLO60437 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPLO60437 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPLO60437 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPLO60437 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPLO60437 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPLO60437 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPLO60437 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PPLO60437 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPLO60437 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPLO60437 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPLO60437 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPLO60437 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPLO60437 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPLO60437 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPLO60437 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPLO60437 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPLO60437 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPLO60437 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PPLO60437 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPLO60437 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PPLO60437 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPLO60437 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPLO60437 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PPLO60437 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPLO60437 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPLO60437 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PPLO60437 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPLO60437 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPLO60437 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPLO60437 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPLO60437 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPLO60437 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPLO60437 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPLO60437 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPLO60437 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPLO60437 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPLO60437 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PPLO60437 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PPLO60437 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPLO60437 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPLO60437 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPLO60437 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPLO60437 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPLO60437 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPLO60437 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPLO60437 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPLO60437 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPLO60437 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPLO60437 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPLO60437 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPLO60437 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPLO60437 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPLO60437 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPLO60437 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPLO60437 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PPLO60437 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PPLO60437 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPLO60437 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPLO60437 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPLO60437 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPLO60437 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPLO60437 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPLO60437 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPLO60437 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPLO60437 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPLO60437 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPLO60437 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPLO60437 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPLO60437 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPLO60437 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPLO60437 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPLO60437 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPLO60437 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPLO60437 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPLO60437 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms