Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms