Protein–RNA interactions for Protein: O14829

PPEF1, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPEF1O14829 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPEF1O14829 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPEF1O14829 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPEF1O14829 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPEF1O14829 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPEF1O14829 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPEF1O14829 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPEF1O14829 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPEF1O14829 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms