Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C1D1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C1D1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C1D1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C1D1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C1D1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C1D1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C1D1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C1D1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C1D1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C1D1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C1D1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C1D1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C1D1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C1D1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C1D1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C1D1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C1D1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C1D1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C1D1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C1D1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C1D1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C1D1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C1D1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C1D1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C1D1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C1D1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C1D1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C1D1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C1D1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C1D1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C1D1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C1D1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C1D1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C1D1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C1D1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C1D1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C1D1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C1D1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C1D1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C1D1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C1D1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C1D1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C1D1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C1D1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C1D1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C1D1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C1D1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C1D1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C1D1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C1D1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C1D1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C1D1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C1D1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C1D1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C1D1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C1D1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C1D1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C1D1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C1D1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C1D1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C1D1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C1D1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C1D1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C1D1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C1D1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
H7C1D1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
H7C1D1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms