Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E9PBE3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E9PBE3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E9PBE3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E9PBE3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E9PBE3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E9PBE3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E9PBE3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E9PBE3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E9PBE3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
E9PBE3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E9PBE3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E9PBE3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E9PBE3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E9PBE3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E9PBE3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E9PBE3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E9PBE3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E9PBE3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E9PBE3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E9PBE3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E9PBE3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E9PBE3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
E9PBE3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E9PBE3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E9PBE3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E9PBE3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E9PBE3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E9PBE3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E9PBE3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E9PBE3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E9PBE3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
E9PBE3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E9PBE3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E9PBE3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E9PBE3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E9PBE3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E9PBE3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E9PBE3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
E9PBE3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
E9PBE3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
E9PBE3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E9PBE3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E9PBE3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E9PBE3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E9PBE3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E9PBE3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E9PBE3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E9PBE3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E9PBE3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E9PBE3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E9PBE3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E9PBE3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E9PBE3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E9PBE3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E9PBE3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E9PBE3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E9PBE3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E9PBE3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E9PBE3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E9PBE3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E9PBE3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E9PBE3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E9PBE3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E9PBE3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms