Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

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Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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